در مطالعهای کوچک محققان دریافتند افرادی که دچار سندرم خستگی مزمن هستند، تنوع گونههای باکتری در رودهشان کمتر از بقیه است. این افراد تعداد بیشتری از باکتریهایی دارند که التهاب را بیشتر میکند و تعداد کمتری از باکتریهایی دارند که التهاب را سرکوب میکند.
یافتههای جدید شواهدی ارائه دادند که این تئوری را رد کرد که سندرم خستگی مزمن در اصل روحی و روانی است. سالهای سال همه فکر میکردند سندرم خستگی مزمن صرفاً یک بیماری روحی است و با مشاوره برطرف میشود. هر چند هنوز علت دقیق این بیماری شناخته نشده اما این تیم تحقیقاتی، اختلال بیولوژیکی دیگری نیز پیدا کردند. همهی افرادی که سندرم خستگی مزمن دارند، میکروبیومشان مشکلدار نیست. چون بعضی از افراد مورد آزمایش، میکروبیوم نسبتاً نرمالی داشتند.